猪红细胞生成素受体基因遗传变异分析  

Genetic Variations in Porcine Erythropoietin Receptor Gene

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作  者:张龙超 王立刚[1] 赵克斌[1] 李勇[1] 颜华[1] 王立贤[1] 

机构地区:[1]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193

出  处:《中国畜牧兽医》2011年第2期125-128,共4页China Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基  金:国家高技术研究发展计划(2008AA10Z133);中国农业科学院基本科研业务费专项(2009qn-5)

摘  要:根据GenBank中登录的猪红细胞生成素受体(erythropoictin receptor,EPOR)基因mRNA序列(登录号:AF274305)和其基因组序列(登录号:EU407778)设计8对引物,以10头北京黑猪和10头大白猪DNA混合池为模板,采用测序的方法研究猪EPOR全基因序列的遗传变异。研究结果发现,EPOR基因长约5.2 kb,含有1个5′UTR、8个外显子、7个内含子及1个3′UTR。经混合DNA池测序,共在内含子区发现9个SNP位点:g.705G>T位于内含子1;g.1450C>T位于内含子2;g.2373C>T位于内含子4;g.2882C>T、g.3035A>G、g.3132A>T、g.3295C>T、g.3942C>T、g.4106G>A位于内含子6,为进一步研究EPOR基因与产仔性状的关联奠定了基础。In this study,8 pair primers were designed based on erythropoietin receptor(EPOR) RNA(AF274305) and DNA(EU407778) sequences in porcine which were submitted on GenBank.Genetic variation was analyzed by sequencing using a DNA pool from 10 Beijing Black pigs and 10 Large white pigs.The results showed that the porcine EPOR gene contains one 5′untranslated region(UTR),eight exons,seven introns,and one 3′UTR,covering at least 5.2 kb of genomic DNA.9 new single nucleotide polymorphisms(SNPs) were identified: g.705GT in intron 1,g.1450CT in intron 2,g.2373CT in intron 4,and g.2882CT,g.3035AG,g.3132AT,g.3295CT,g.3942CT and g.4106GA in intron 6.

关 键 词: EPOR基因 遗传变异 

分 类 号:S813[农业科学—畜牧学]

 

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