海南岛东部501站位沉积物古细菌多样性研究  被引量:2

Phylogenetic analysis of archaeal community from the sediment at location 501 at the east of Hainan island

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作  者:刘国辉[1,2] 吴后波[1] 李翔[1] 颜文[3,4] 

机构地区:[1]中国科学院南海海洋研究所LMB实验室,广东广州510301 [2]中国科学院研究生院,北京100049 [3]中国科学院广州天然气水合物研究中心,广东广州510070 [4]中国科学院边缘海重点实验室,广东广州510301

出  处:《海洋科学》2011年第2期86-91,共6页Marine Sciences

基  金:中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX2-YW-211-03);中国科学院南海海洋研究所创新领域前沿项目(lyqy200312)

摘  要:从海南岛东部501站位沉积物中扩增古菌16S rRNA基因构建文库,并对得到的OTU(Operation taxonomic units)进行系统发育学分析。古菌文库由泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota)构成,其中泉古生菌占总克隆文库的96.8%,由Ⅰ型海洋泉古生菌(Mraine crenarchaeotic groupⅠ,MGⅠ,74.6%)、GROUP A(14.9%)和GROUP B(7.2%)三簇组成。广古生菌GROUP C簇占总克隆文库的3.2%,序列比对结果显示它们与甲烷微菌纲(Methanomicrobial)中甲烷厌氧氧化菌(ANME)和甲烷八叠球菌目(Methanosarcinales)有较近的系统发育学关系。研究表明海南岛东南部近岸沉积物古菌多样性比较丰富,泉古生菌是该站位古菌的优势菌。Diversity of archaea was studied in marine sediment by PCR amplification and sequence analysis of 16S rRNA.Samples were from a site at the east of Hainan island.The phylogenetic analysis revealed that archaeal population was composed of Crenarchaeota and Euryarchaeota.Mraine crenarchaeotic groupⅠ(74.6%),GROUP A(14.9%) and GROUP B(7.2%) fall into Crenarchaeota.The GROUP C sequences were closely related to ANME and Methanosarcinales.The result indicates that archaea are diversified in surface environment of subseafloor sediment and Crenarchaeota is the predominant aechaea.

关 键 词:海洋沉积物 16S RDNA 古菌 

分 类 号:Q938[生物学—微生物学]

 

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