利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法探讨  

Application of MassArray Platform in Analyzing of Specific Methylation Modification

作　　者：王理[1] 上官少方[1] 马晓红[1] 张霆[1] 

机构地区：[1]首都儿科研究所,北京100020

出　　处：《现代生物医学进展》2011年第4期618-623,共6页Progress in Modern Biomedicine

基　　金：科技部973项目(2007CB511901);国家自然科学基金(81000249/H0417);北京市卫生局青年科学研究资助项目基金(2010-2012)

摘　　要：目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法。方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点。结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列技术平台能够反映甲基化修饰的真实水平;通过不同条件下PCR扩增效率与甲基化分析的结果,发现扩增效率是制约MassArray分子量阵列技术平台甲基化分析的关键因素,而产物的放置时间和不同的处理没有明显影响甲基化分析。结论:Mas-sArray甲基化分析平台是高效快速检测甲基化修饰的平台,在使用过程中应该根据实际的实验条件,进行合理的质控。Objective：To investigate the methods of specific methylation modification by massarray platform.Methods：Charac-ters of MassArray platform were analyzed by comparing the test efficiency under different amplify and treatment conditions.Results：MassArray platform could detect a real methylation modification of gene by comparing with bisulfite sequencing.By comparing different amplifications,PCR efficiency was a key point for methylation analysis on this platform,while no significant difference was established on standing time and treatments after PCR.Conclusions：MassArray platform is a powerful tool for methylation analysis,quality control according to characters of fragment is needed for this platform.Our research provided fundamentals for further methylation studies using MassArray platform.

关 键 词：MassArray分子量阵列技术平台 甲基化 重亚硫酸盐测序 扩增效率 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学] Q78