紫花苜蓿几丁质酶ClassⅠ基因cDNA全长克隆及序列分析  

作　　者：伊亚莉[1] 关宁[1] 张文娟[1] 王涌鑫[1] 苗丽宏[1] 李聪[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室,北京100193

出　　处：《江苏农业科学》2011年第2期29-34,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家科技支撑计划(编号:2006BAD01A19);农业部苜蓿种质资源保种专项

摘　　要：依据NCBI中已登录的截形苜蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段EST序列(GenBank登录号:AF167323)设计引物,以紫花苜蓿(Medicago sativaL.)为试验材料,利用RACE技术进行cDNA全长克隆。利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132 bp,其中含有1个930 bp的开放阅读框,编码309个氨基酸。分子质量为33.538 ku,等电点pI为5.258,是一个酸性蛋白且分泌到胞外。将该基因命名为MsChiⅠ(GenBank登录号为HM224449)。聚类分析显示:它与其他已知植物ClassⅠ类几丁质酶基因具有高度的同源性;结构分析表明:该蛋白的二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规则卷曲分别占25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,属于几丁质酶第19家族。

关 键 词：紫花苜蓿 几丁质酶基因 CDNA克隆 序列分析 

分 类 号：Q785[生物学—分子生物学]