梅(Prunus mume)IRAP分子标记技术体系的建立  被引量:5

A technique system of IRAP marker on mei(Prunus mume)

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作  者:沈玉英[1,2] 高志红[1] 王飞[1] 佟兆国[1] 房伟民[1] 章镇[1] 

机构地区:[1]南京农业大学园艺学院,南京210095 [2]浙江建设职业技术学院,杭州311231

出  处:《果树学报》2011年第3期423-427,共5页Journal of Fruit Science

基  金:国家自然科学基金(30070530);农业部公益性行业(农业)科研专项(201003058)

摘  要:基于梅Ty1-copia类逆转座子的长末端重复序列信息设计IRAP引物,通过五因素四水平L16(45)的完全随机正交试验、不同浓度PAGE胶等的研究,建立了适合梅IRAP标记的技术体系。结果表明,体系总体积25μL,其中基因组DNA 30 ng、25 mmol·L-1 MgCl2 2.0μL、2.5 mmol·L-1 dNTPs 2.5μL、10×PCR Buffer 2.5μL、Taq DNA聚合酶1.0 U、10μmol·L-1 LTR引物1.0μL,加ddH2O至25μL为最优IRAP的PCR反应体系,以及6.0%和8.0%浓度的非变性PAGE胶均适于IRAP多态性检测。这为进一步利用IRAP分子标记研究梅的遗传多样性和亲缘关系等奠定坚实的基础。Based on the Ty1-copia retrotransposons LTR sequences of Mei,primers for IRAP were designed.Studied on five factors L16(45),four levels complete random orthogonal test,the various PAGE concentrations,etc.,the final optimal system of IRAP marker technique is established.The results showed that the optimal system for IRAP was total in 25 μL,composed of template DNA 30 ng,25 mmol·L-1 MgCl2 2.0 μL,2.5 mmol·L-1 dNTPs 2.5 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,Taq DNA polymerase 1.0 U,10 μmol·L-1 LTR primer 1.0 μL,and ddH2O added to 25 μL.PAGE with the concentration of 6.0% and 8.0% non-denaturing polyacrylamide gel could present genetic diversity.

关 键 词: IRAP 技术体系 

分 类 号:S662.4[农业科学—果树学]

 

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