一种测定水稻白叶枯菌基因组中插入序列IS1112拷贝数的定量PCR方法  

A real-time quantitative PCR method for identifying the copies of the insertion sequence IS1112 in Xanthomonas oryzae pv.oryzae genome

作　　者：佘宇佳 谢家建[1] 王锡锋[1] 高必达[2] 

机构地区：[1]中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193 [2]湖南农业大学生物安全科技学院,长沙410128

出　　处：《植物保护》2011年第3期99-103,共5页Plant Protection

基　　金：国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2007CB109201);国家科技支撑计划项目(2006BAD08A04)

摘　　要：建立了以标准质粒为基础的测定水稻白叶枯基因组中插入序列IS1112拷贝数的TaqMan实时荧光定量PCR方法。通过重叠PCR方法扩增了由16S rDNA基因与插入序列IS1112的部分片段组成的重组片段,连接到载体pMD18-T上,构建了标准质粒。利用该标准质粒建立的定量方法测定了我国12种白叶枯菌株基因组中IS1112的拷贝数。A TaqMan realtime quantitative PCR method with standard plasmid was established to identify the copies of the insertion sequence IS1112 in Xanthomonas oryzae pv. oryzae genome. Recombinant fragment of 16S rDNA gene and insertion sequence IS1112 were amplified by overlapping PCR and ligated into the vector pMD18T to develop the standard plasmid. The copies of IS1112 in twelve Xoo strains from China were identified using realtime quantitative PCR with this standard plasmid.

关 键 词：插入序列IS1112 拷贝数 定量PCR 标准质粒 水稻白叶枯病菌 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学]