2009～2010年上海地区急性呼吸道感染病毒病原谱分析  

Study on the viral etiology of acute respiratory tract infections in Shanghai area during 2009-2010

作　　者：何静[1] 龚燕[2] 张万菊[1] 徐磊[1] 刘祎[1] 钱方兴[3] 揭志军[4] 俞慧菊[4] 李杨[5] 周志统[1] 胡芸文[1] 

机构地区：[1]上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心病原体检测与生物安全部,上海201508 [2]复旦大学附属华山医院,上海200040 [3]上海市长宁区中心医院,上海200051 [4]上海交通大学医学院附属新华医院,上海200092 [5]同济大学附属东方医院,上海200120

出　　处：《微生物与感染》2011年第2期90-96,共7页Journal of Microbes and Infections

基　　金："十一五"国家科技重大专项(2009ZX10004-211)

摘　　要：调查2009-2010年上海地区人群急性呼吸道感染（ARTI）的病毒性病原,探讨2009甲型H1N1流感暴发背景下呼吸道感染病毒病原谱的构成。采用套式多重反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）和实时荧光定量RT-PCR方法,对来自2 044例患者的2 044份标本（包括2 005份鼻咽拭子和39份肺泡灌洗液）,同时检测腺病毒（ADV）、副流感病毒（PIV）、甲型流感病毒（FluA）、乙型流感病毒（FluB）、微小核糖核酸病毒、呼吸道合胞病毒（RSV）、人偏肺病毒（hMPV）、冠状病毒（CoV）和人博卡病毒（HBoV）。其中,656（32.09%）份标本经呼吸道病毒检测为阳性,52份标本为双重感染。FluA检出率最高（13.36%）,其后依次为微小核糖核酸病毒（10.23%）、FluB（4.84%）、ADV（1.96%）、PIV（1.76%）、RSV（1.32%）、CoV（0.59%）、hMPV（0.39%）和HBoV（0.20%）。但各月病毒检出率分布不均,2009和2010年呼吸道病毒检出率高峰出现在当年11月（53.07%和65.59%）,低谷都出现在当年5月,且2009年5-9月的病毒检出率高于2010年同期（32.02%vs15.38%,P〈0.05）。其中,2009甲型H1N1流感暴发导致2009年10月-2010年1月2009甲型H1N1流感病毒占当月检出FluA的100%,2009年6-9月也占当月检出FluA的较高比率,依次为90.91%（20/22）、75.00%（15/20）、48.00%（12/25）和56.25%（18/32）。比较甲型H3N2流感病毒和2009甲型H1N1流感病毒分别在上呼吸道感染（URTI）和下呼吸道感染（LRTI）中的检出率,无统计学差异（URTI,85.29%vs76.61%;LRTI,14.71%vs23.39%;P〉0.05）。呼吸道病毒检出率还与年龄相关,0-4岁组和5-14岁组病毒检出率高于其他年龄组。在0-4岁及≥65岁组中,微小核糖核酸病毒检出率最高,FluA次之;其余年龄组中FluA检出率最高。混合感染中15岁以下儿童占50%（26/52）,微小核糖核酸病毒与其他病毒混合感染占84.62%（44/52）。本研究表明,上海地区2009-2010年FluA是最常见的急性呼吸�The present paper aims to understand the viral etiology in patients with acute respiratory tract infections（ARTIs） in Shanghai area during 2009-2010 and to explore the respiratory viral spectrum under the background of 2009 A（H1N1） influenza outbreak worldwide.A total of 2 005 nasopharyngeal swab and 39 lavage fluid specimens from 2 044 patients were analyzed by nested multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction（RT-PCR） and real-time quantitative RT-PCR for detection of common respiratory viruses,including adenovirus（ADV）,parainfluenza virus（PIV）,influenza virus A（FluA）,influenza virus B（FluB）,picornavirus,respiratory syncytial virus（RSV）,human metapneumovirus（hMPV）,coronavirus（CoV）,and human Boca virus（HBoV）.The results showed that 656 out of 2 044 specimens（32.09%） were positive for one or more viruses,52 specimens were positive for two viruses.FluA（13.36%） was the dominant agent detected,followed by picornavirus（10.23%）,FluB（4.84%）,ADV（1.96%）,PIV（1.76%）,RSV（1.32%）,CoV（0.59%）,hMPV（0.39%）,and HBoV（0.20%）.The viral detection rates changed regularly within the two-year study period.The peak detection rate occurred in November and the lowest rate occurred in May within the two-year study period.The viral detection rate during May to September in 2009 was significantly higher than the rate during the same period in 2010（32.02% vs 15.38%,P0.05）.Additionally,during October 2009 to January 2010,all FluA-positive specimens were 2009 A（H1N1） influenza virus and the frequencies（ratios） of 2009 A（H1N1） influenza virus in FluA positive-specimens were 90.91%（20/22）,75.00%（15/20）,48.00%（12/25） and 56.25%（18/32） in June,July,August,and September in 2009,respectively.The frequency of upper respiratory tract infections（URTIs） or lower respiratory tract infections（LRTIs） caused by H3N2 or 2009 A（H1N1） influenza virus was similar（URTI,85.29% vs 76.61%;LRTI,14.71% vs 23.39%;P0.05）.Viral d

关 键 词：急性呼吸道感染 病原谱 流行性感冒病毒 

分 类 号：R56[医药卫生—呼吸系统]