耐辐射球菌RNA聚合酶β亚基突变对基因表达全局的影响  

作　　者：华孝挺[1,2] 汪虎[2] 王超[2] 田兵[2] 华跃进[2] 

机构地区：[1]浙江大学医学院附属邵逸夫医院感染科,杭州310016 [2]浙江大学原子核农业科学研究所农业部和浙江省核农学重点实验室,杭州310029

出　　处：《中国科学：生命科学》2011年第7期577-585,共9页Scientia Sinica(Vitae)

基　　金：国家自然科学基金(批准号:30830006;31000045);国家高技术研究发展计划(批准号:2007AA021305);重大新药创新科技重大专项(批准号:2009ZXJ09001-034);转基因生物新品种培育重大专项(批准号:2009ZX08009-075B4);农业部行业专项(批准号:200803034)资助

摘　　要：RNA聚合酶的β亚基参与与利福平的结合,并在原核生物中高度保守.许多细菌中利福平耐药株的rpoB基因均有氨基酸改变.本实验室曾分离2两株耐辐射球菌(Deinococcus radiodurans)自发突变利福平耐药株(突变为:L420R和1258-669-bp缺失).本研究发现,β亚基的变化对生长速度有独特的效果.利用DNA芯片技术和生化分析鉴定耐辐射球菌的利福平突变株如何调控基因表达改变生长速度的分子机制.参与代谢、细胞进程和信号传递以及信息贮存和处理的基因的转录在9bp缺失突变株中显著改变.9bp缺失突变株的上调基因的共有启动子序列为富含AT的序列.与野生株相比,L420R和9bp缺失突变株积聚了更多的活性自由基.这些结果初步探讨了β亚基突变调控基因的表达机制.

关 键 词：rpoB利福平 耐辐射球菌 转录组 芯片 

分 类 号：Q78[生物学—分子生物学]