SRAP体系优化及在胡枝子亲缘关系中的应用  

Optimization of SRAP System and Its Preliminary Application in Genetic Relationship Analysis of Lespedeza

作　　者：骈瑞琪[1,2] 倪慧群[1,3] 欧阳昆唏[2] 李伟[2] 陈晓阳[1] 

机构地区：[1]华南农业大学林学院,广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东广州510642 [2]北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083 [3]华南农业大学科技处,广东广州510642

出　　处：《华南农业大学学报》2011年第3期63-67,共5页Journal of South China Agricultural University

基　　金：“863”国家高技术研究发展计划(2002AA241111);木本豆科饲料植物胡枝子产业化示范项目(2006D90204004)

摘　　要：利用正交设计L16(45)对胡枝子SRAP-PCR反应体系的5种因素(模板、Mg2+、dNTPs、引物、Taq酶)在4个水平上进行优化试验,筛选出各因素的最佳水平,建立了胡枝子SRAP-PCR反应的最佳体系(25μL):模板DNA40 ng,dNTPs 0.16 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/L,Taq酶1.0 U,引物0.64μmol/L.采用优化的扩增体系对10种胡枝子进行了SRAP分子标记分析.筛选出的10对引物共扩增出274条带,其中244条为多态性带,占89.01%.平均每对24条.多态性条带最多的是引物组合Me21/Em1和Me6/Em9,均达到29条.10种胡枝子种间遗传距离的变异幅度为0.221～0.632.聚类分析表明以0.49为阀值,可以将10种胡枝子分为4大类.Orthogonal design was used to optimize SRAP-PCR amplification system for Lespedeza in terms of five factors（Taq DNA polymerase,Mg2＋,DNA template,dNTPs and primer） from four levels.An optimal SRAP-PCR system for Lespedeza was obtained as 40 ng DNA template,1.5 mmol/L Mg2＋,1.0 U Taq DNA polymerase,0.16 mmol/L dNTPs,0.64 μmol/L primer for 25 μL reaction system.The phylogenetic relationship of 10 species of Lespedeza was investigated using SRAP technique.SRAP analysis produced 274 bands by using the 10 most informative primer pairs,244（89.01%） of which were polymorphic.Cluster analysis indicated that the 10 species of Lespedeza can be divided into four groups.

关 键 词：胡枝子 SRAP 优化 亲缘关系 

分 类 号：Q949.92[生物学—植物学] S541.5[农业科学—作物学]