兴安落叶松肌动蛋白基因的分离与序列分析  被引量:2

Isolation and Sequence Analysis of Larix gmelinii Actin Gene

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作  者:朱雯雯[1] 林晓飞[1] 张文波[2] 许月英[1] 高野博嘉 

机构地区:[1]内蒙古大学生命科学学院,呼和浩特010021 [2]内蒙古农业大学林学院,呼和浩特010019 [3]熊本大学自然科学研究科

出  处:《生物技术通报》2011年第7期95-100,共6页Biotechnology Bulletin

基  金:国家自然科学基金项目(30960030);内蒙古自然科学基金项目(2009MS0505);内蒙古大学高层次引进人才科研启动基金项目(Z20080215)

摘  要:以兴安落叶松(Larixgmelinii)实生苗为材料,提取总RNA和基因组DNA;利用兼并PCR及RACE技术克隆肌动蛋白基因(Lg-act)。序列分析的结果显示,该基因cDNA全长1 662 bp,编码377个氨基酸;基因组DNA长度约为2 564 bp,包含4个内含子,5个外显子。所克隆的Lg-act cDNA序列与GenBank中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性均在77%以上,氨基酸序列的相似性高达93%以上。根据高等植物肌动蛋白相似性构建的系统树显示,兴安落叶松肌动蛋白与挪威云杉肌动蛋白之间的亲缘关系较为密切,在进化中分化时间最为接近。Total RNA and genomic DNA were extracted from Larix gmelinii seedlings,and full-length sequences of L.gmelinii actin gene,named as Lg-act,were isolated by using degenerate-PCR and RACE technique.The cloned Lg-act cDNA was 1 662 bp in length,encoding a protein of 377 amino acids,which shows more than of 77% nucleotide sequence similarity and more than of 93% amino acid sequence similarity to other plant actin genes.Genomic DNA of the Lg-act contains 2 564 bp,including 4 introns and 5 exons.The phylogenetic tree generated from the deduced amino acid sequences of plant actins revealed that the L.gmelinii and Picea abies actins is in a sister group to the clade of angiosperms,corresponding to plant evolutionary history.

关 键 词:兴安落叶松 肌动蛋白 基因克隆 序列分析 

分 类 号:S791.22[农业科学—林木遗传育种] Q943.2[农业科学—林学]

 

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