鸭病毒性肠炎病毒基因组异构体的研究  被引量:4

Isomer identification of duck enteritis virus genome

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作  者:柳金雄[1] 陈普成[1] 邬丽[1] 姜永萍[1] 陈化兰[1] 

机构地区:[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点实验室/兽医生物技术国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150001

出  处:《中国预防兽医学报》2011年第8期658-660,共3页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基  金:国家科技支撑计划项目(2006BAD06A05)

摘  要:为研究鸭病毒性肠炎病毒(DEV)基因组异构体的存在形式,本研究在已建立的以pCC1FOS为载体的DEV疫苗株基因文库基础上对DEV全序列进行了测定,并进一步对DEV基因组的异构体进行了研究。对261个重组fosmid中的DEV基因组片段的末端序列进行测序及序列分析,初步证明了DEV基因组有3种异构体,即P型、IS型和ILS型,未发现IL型的存在。并且,以上3种异构体在基因组中所占比例分别为77.1%、8.6%和14.3%。通过对11个重组fosmid的全序列测定,进一步确认了以上3种异构体的存在。该结果为DEV的分类提供了重要实验依据。To study the isomer structure of duck enteritis virus (DEV) genome, we end-sequenced 261 DEV fosmid DNAs which randomly chosed from the DEV genome fosmid library constructed in our previous study. Sequence assembled results showed that 3 kinds of isomeric forms were found in DEV genome, including P (prototype), IS (inversion of US) and ILS (inversion of UL and US) in matured virions of DEV, and the P isomeric form was account for 77.1% in the genome, IS for 8.6% and ILS for 14.3%. Complete sequencing of 11 fosmids which contain the junction of UL and US further confirmed the finding. This result provided an important evidence for DEV classification.

关 键 词:鸭病毒性肠炎病毒 FOSMID文库 异构体 

分 类 号:S852.65[农业科学—基础兽医学]

 

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