麻栎ISSR-PCR扩增条件的优化  被引量:3

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作  者:彭礼琼[1,2] 金则新[2] 祁彩虹[2,3] 李钧敏[2] 王强[2,4] 

机构地区:[1]北京林业大学自然保护区学院,北京100083 [2]台州学院生态研究所,浙江临海317000 [3]西南大学三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆400715 [4]上海师范大学生命与环境科学学院,上海200234

出  处:《江苏农业科学》2011年第4期30-32,共3页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:浙江省自然科学基金(编号:Y507660)

摘  要:采用改进的SDS法提取麻栎基因组DNA,利用单因素试验对ISSR反应体系中的Mg2+浓度、dNTP浓度、模板DNA用量、TaqDNA聚合酶用量、BSA浓度、引物用量进行筛选和优化,得出了适用于麻栎ISSR分析的扩增条件:10μL PCR反应体积,1×Taq酶配套缓冲液(200 mmol/L Tris.HC l,pH值8.8,100 mmol/L KC l,1%TritonX-100,100 mmol/L(NH4)2SO4,15 mmol/L MgC l2),0.75 UTaqDNA聚合酶,10 ng模板DNA,10 pmol引物,0.4 mmol/LdNTP,3.5 mmol/L Mg2+。利用优化反应体系从100个ISSR引物中筛选出12个重复性好、稳定性高的引物对21个麻栎个体的DNA进行扩增,共得到85个位点,其中61个为多态位点,多态位点百分率为71.76%,Ne i指数为0.322 2,Shannon信息指数为0.459 3,表明麻栎的遗传多样性处于较高水平。

关 键 词:麻栎 ISSR 优化 遗传多样性 

分 类 号:S792.181[农业科学—林木遗传育种]

 

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