水稻DnaJ蛋白的生物信息学分析  

Bioinformatic analysis of the DnaJ protein family in rice

作　　者：赵旭[1] 刘向国 王爱荣[1,3] 

机构地区：[1]福建农林大学生物农药重点实验室,福建福州350002 [2]福州市园林科学研究院,福建福州350003 [3]福建农林大学计算机与信息学院,福建福州350002

出　　处：《亚热带农业研究》2011年第3期206-211,共6页Subtropical Agriculture Research

基　　金：福建省科技厅青年人才项目(2007F3011);福建农林大学青年教师科研基金项目(07A02)

摘　　要：DnaJ蛋白是一类很大的蛋白家族,因含有保守的DnaJ结构域而得名。本文对水稻DnaJ蛋白进行了生物信息学分析表明,水稻中共有101个DnaJ蛋白,分为典型的三大类。通过表达证据搜索发现,除了11个基因没有表达证据外,其他基因在水稻中都有表达。此外,对水稻的DnaJ蛋白家族进行了初步的进化分析。DnaJ proteins got the name due to their DnaJ domains belonging to a big family.All of DnaJ proteins were identified by searching the Oryza sativa L.ssp.japonica protein database.The bioinformatics analysis showed that there are 101 genes coding DnaJ proteins classified into 3 typical categories in rice genome.The result of gene expression evidence search showed that almost all of these genes expressed in rice except 11 genes.In addition,the evolution of the rice DnaJ protein family was analyzed.

关 键 词：水稻 DnaJ蛋白 基因家族 基因表达 进化分析 

分 类 号：S511[农业科学—作物学] Q71[生物学—分子生物学]