猪戊型肝炎病毒甘肃分离株衣壳蛋白基因序列分析  

作　　者：郝宝成[1,2] 梁剑平[1,3] 兰喜[2] 刑小勇[3] 项海涛[3] 温峰琴[3] 胡永浩[3] 柳纪省[2,3] 

机构地区：[1]中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所/农业部兽用药物创制重点实验室/甘肃省新兽药工程重点实验室,甘肃兰州730050 [2]中国农业科学院兰州兽医研究所,甘肃兰州730046 [3]甘肃农业大学动物医学院,甘肃兰州730070

出　　处：《畜牧与兽医》2011年第10期56-59,共4页Animal Husbandry & Veterinary Medicine

基　　金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(BRF090402)

摘　　要：为进行国内猪戊型肝炎病毒(HEV)衣壳蛋白基因特征研究,参照GenBank中已发表的戊型肝炎病毒核苷酸序列,设计了1对扩增HEV衣壳蛋白(Y)基因的引物,利用RT-PCR等方法成功克隆出HEV甘肃分离株swCH189的Y基因cDNA片段,并与国内其他9株典型HEV分离株进行序列分析,用DNAstar软件进行序列同源性分析,PHYLIP软件绘制基因进化树。结果表明,swCH189株的Y基因与国内9株典型HEV分离株间的核苷酸序列同源性为79.6%～91.8%,推导的氨基酸序列同源性为91.4%～98.85%。基因进化树显示swCH189与基因Ⅳ型swCH25株亲缘关系最近,在同一分支上,属于基因Ⅳ型。

关 键 词：猪戊型肝炎病毒 衣壳蛋白基因 序列分析 

分 类 号：S852.722[农业科学—基础兽医学]