两种蛤仔线粒体16S rRNA基因和COⅠ基因的序列比较  被引量:2

Molecular phylogeny of the genus Ruditapes (Mollusca:Bivalvia) based on mitochondrial 16S and COI sequences

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作  者:刘相全[1] 包振民[2] 方建光[3] 王如才[2] 

机构地区:[1]山东省海洋水产研究所,山东烟台264006 [2]中国海洋大学,山东青岛266003 [3]中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071

出  处:《海洋科学》2011年第10期27-33,共7页Marine Sciences

基  金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2002AA603015);山东省农业良种工程课题“优质高产抗逆贝类良种选育”

摘  要:对菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum)和杂色蛤仔(Ruditapes variegata)的线粒体16S rRNA基因和COⅠ基因序列进行了分析。结果表明,16S序列共有117个变异位点,COⅠ序列共有160个变异位点,COⅠ基因编码的219个氨基酸序列中有29个不同。根据16S序列和COⅠ基因编码的氨基酸序列进行聚类分析,两种蛤仔与硬壳蛤(Mercenaria mercenaria)之间的聚类结果并不一致,有必要对缀锦蛤亚科更多的相近种进行序列分析。DNA sequence comparisons of two mitochondrial DNA genes were used to infer phylogenetic relationships of the genus Ruditapes. The 16S rRNA gene displayed 117 variable sites and the CO I gene displayed 160. There were 29 variable amino acid residues among the 219 of the CO I gene. Phylogenetic analysis using sequences of 16S rRNA gene and CO I gene yielded trees with different topology. More sequences among more species of subfamily Tapetinae would contribute to improve existing classification systems.

关 键 词:菲律宾蛤仔(Ruditapes philippinarum) 杂色蛤仔(Ruditapes variegata) mtDNA 16S rRNA基因 COⅠ基因 

分 类 号:S968.3[农业科学—水产养殖]

 

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