HLA-I类基因新等位基因HLA-B*52:11的序列分析及确认  被引量:2

A new human leukocyte antigen class I allele, HLA- B * 52:11

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作  者:李晓丰 章旭 张坤莲 陈阳 刘显智 李剑平 

机构地区:[1]辽宁省血液中心,沈阳110044

出  处:《中华医学遗传学杂志》2011年第6期712-715,共4页Chinese Journal of Medical Genetics

基  金:基金项目:辽宁省自然科学基金(20062127);沈阳市科学计划项目(10813249-00)

摘  要:目的序列分析及确定1个HLA新等位基因。方法应用基于Luminex平台的聚合酶链式反应序列特异性寡核苷酸探针(polymerasechainreaction—sequencespecificoligonucleotideprobes,PCR—SSOP)基因分型方法、PCR产物测序和基因克隆测序方法,通过软件分析该基因序列及与最相近等位基因的序列差异。结果PCRSSOP结果显示,该样品HI.A—I类基因B位点反应格局出现异常提示;测序结果最终表明其B位点第3外显子序列与所有已知HI。AB等位基因序列均不一致,在所检测的外显子第2、3、4区域中,与序列最相近的等位基因HLA—B*52:01:01的差异只是在第3外显子产生了nt583C→T一个核苷酸替代,并导致相应的195位密码子由CAC(H)→TAC(Y),氨基酸组成由组氨酸变为酪氨酸。结论经序列分析1个HLA—I类基因的新等位基因被确认.已被世界卫生组织HI。A因子命名委员会正式命名为HLAB*52:11。Objective To identify and confirm a novel HLA allele. Methods A new human leukocyte antigen class I allele was found during routine HI.A genotyping by polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide prohes(PCR-SSOP) and sequencing-based typing (SBT). Results The novel HLA B * 52 allele was identical to B * 52 ..01:01 with an exception of one base substitution at position 583 of exon 3 where a 'C' was changed to 'T' resulting in codon 195 changed from CAC(H) to TAC(Y). Conclusion A new HLA class I allele, B * 52: 11, is identified, and is named officially by the WHO Nomenclature Committee.

关 键 词:HLA—I类基因 HI A-B*52:11 序列分析 

分 类 号:R440[医药卫生—诊断学]

 

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