牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析  

Genomic cloning and sequence analysis of a bovine viral diarrhea virus Ⅱ

作　　者：刘华[1] 付培芬[1] 李岩[1] 温凯[1] 贾莹[1] 刘晓玫[1] 张海丽[1] 商云鹏[1] 高明春[1] 马波[1] 张文龙[1] 王君伟[1] 

机构地区：[1]东北农业大学动物医学院,黑龙江哈尔滨150030

出　　处：《中国预防兽医学报》2012年第1期24-27,共4页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-37)

摘　　要：为研究牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的分子特征,本研究参考GenBank中登录的BVDV基因Ⅱ型病毒株全基因组序列,设计多对引物,通过RT-PCR方法,对一株分离自某商品化血清中的BVDV分离株HLJ-10全基因组进行分段克隆及序列测定,获得了该分离株的全基因组序列。生物信息学分析表明,该分离株为BVDV基因Ⅱ型,全长12 284 nt,编码区为11 694 nt,共编码3 897个氨基酸,5'和3'非编码区分别为385 nt和205 nt。与其它BVDV参考株序列比对分析表明,HLJ-10与SH-28和KZ91CP进化关系较密切,预测该分离株含有22个潜在糖基化位点,氨基酸差异性分析表明E2蛋白的氨基酸序列在瘟病毒属中变异性较大。The complete genome of a bovine viral diarrhea virus（BVDV） Ⅱ isolate was cloned and sequenced.The genome of the isolate was 12,284 nucleotides（nt） in length,which contained a 11,694 nt open reading frame with 22 potential N-glycosylation sites,a 385 nt 5＇untranslated region（UTR） and a 205 nt 3＇UTR.The complete genomic sequence of HLJ-10 was submited into GenBank.Comparing to other reference strains,the isolate of HLJ-10 had a high sequence identity with reference strains of SH-28 and KZ91CP.

关 键 词：牛病毒性腹泻病毒 基因组 序列分析 

分 类 号：S852.65[农业科学—基础兽医学]