新型杀虫晶体蛋白Cry7Ab4空间结构的计算机解析  被引量:1

Structural Analysis of a Novel Insecticidal Crystal Protein Cry7Ab4

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作  者:洪雪梅[1] 林毅[2] 

机构地区:[1]华侨大学信息科学与工程学院,福建厦门361021 [2]华侨大学化工学院,福建厦门361021

出  处:《华侨大学学报(自然科学版)》2012年第1期60-64,共5页Journal of Huaqiao University(Natural Science)

基  金:教育部科学技术研究重点项目(211205);福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划项目(2006年度);福建省自然科学基金资助项目(2011J01221);植物病虫害生物学国家重点实验室开放基金资助项目(2007IP7)

摘  要:采用一级结构分析,二级结构预测及同源比对建模的方法,模拟出新型杀虫晶体蛋白Cry7Ab4的空间结构,并进行动力学优化.结合其杀大猿叶甲活性数据与蛋白结构比对分析,发现Cry7Ab4与Cry7Aa1的活性差异主要归因于α3,α4上疏水性氨基酸的不同.The initial spatial structure of a novel insecticidal crystal protein Cry7Ab4 was constructed by primary structure analysis,secondary structure prediction and homologous alignment modeling,and then optimized by molecular mechanics method.In addition,the structural difference between Cry7Ab4 and Cry7Ab1 was compared by NCBI Blastp.It showed that the hydrophobic amino acids in α3,α4 were responsible for their difference of insecticidal activities against Colaphellus bowringi.

关 键 词:苏云金芽孢杆菌 杀虫晶体蛋白 Cry7Ab4 空间结构 构效关系 

分 类 号:Q518.1[生物学—生物化学] TP311.1[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]

 

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