基于本体的临床试验数据语义查询  

Ontology-based semantic query for clinical trials

作　　者：黄必清[1] 王涛[1] 朱鹏[1] 薛霄[1] 吴芸 

机构地区：[1]清华大学国家CIMS工程技术研究中心,北京100084 [2]徐州雷奥医疗设备有限公司,徐州221116

出　　处：《清华大学学报（自然科学版）》2012年第1期47-54,共8页Journal of Tsinghua University(Science and Technology)

基　　金：国家"十一五"科技支撑计划资助项目(2008BAH24B01;2008BAH24B03)

摘　　要：临床试验数据的描述中多自然语言、多专业医学术语的特点使得用户难以通过自定义的关键字快速定位所需的资源。该文采用基于本体的方法实现对于临床试验数据的语义查询。该系统的实现步骤如下:使用OWL(Web on-tology language)构建基于ICD-10和ICMJE标准的本体,包含疾病和临床试验类;从Clinical Trials注册库获取临床试验数据,标注为本体中的临床试验类实例;建立临床试验实例与疾病实例的联系;借助SPARQL实现对于临床试验数据结构化的查询。使用上述方法,用户能够通过疾病实例和相关属性的关键字,表达结构化的语义查询条件,精确定位所需的临床试验。与传统的仅基于关键字匹配的查询方法相比,该方法所表达的查询条件能够更加准确地描述用户的查询需求。The extensive medical terminology used to describe clinical trials complicates Key words searches to locate resources.This paper presents an ontology-based semantic query system for clinical trial descriptions.This system uses the Web ontology language（OWL） to create the ontology based on ICD-10 and ICMJE（the ontology includes a clinical trial class and a disease class）,retrieves clinical trial data from ClinicalTrials.gov,annotates the data as instances of the clinical trial class and creates relationships between the clinical trials and diseases to enable structured semantic clinical trial queries using SPARQL.Through this method,users can use disease and property Key words to express the structured semantic query and locate the resources.The query conditions generated by this method more accurately meet the user＇s needs than traditional queries.

关 键 词：语义查询 本体 网络本体语言(OWL) SPARQL 

分 类 号：TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术]