福建及贵州等地烟草青枯菌系统发育分析  被引量:20

Phylogeny of tobacco Ralstonia solanacearum strains from Fujian and Guizhou Provinces

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作  者:潘哲超[1,2] 徐进[1] 顾钢 吴畏[4] 许景升[1] 陈顺辉 冯洁[1] 

机构地区:[1]中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京100193 [2]云南省农业科学院经济作物研究所,昆明650205 [3]福建省烟草农业科学研究所,福州350003 [4]西南大学植物保护学院,重庆400715

出  处:《植物保护》2012年第1期18-23,43,共7页Plant Protection

基  金:国家重点基础研究发展计划(“973”)(2009CB119200);国家高技术研究与发展计划(“863”)(2006AA10Z432);国家科技支撑计划(2006BAD08A14);国家自然科学基金(30671418);闽烟科技项目合同号([2008]196号)

摘  要:[目的]探寻烟草上青枯菌的系统发育。[方法]采用演化型分类框架对福建及贵州等地的62个烟草青枯病菌株进行鉴定分析。[结果]基于内切葡聚糖酶基因系统发育学的分析结果表明:所有参试菌株均归属于青枯菌亚洲分支的4个序列变种,分别为序列变种15、17、34和44;尚未发现归属于美洲或非洲分支的烟草青枯病菌株。其中序列变种15和17为优势菌系,序列变种34的菌株都来自福建省,只发现3个菌株属于序列变种44。基于avrA基因的氨基酸序列比对结果表明4个序列变种的avrA基因都属于RS1000类型。[结论]本研究表明福建及贵州等地烟草上的青枯菌存在一定的遗传分化。[Objective]The phylogeny of tobacco Ralstonia solanacearum strains from Fujian and Guizhou was studied.[Method]Sixty-two Chinese R.solanacearum strains isolated from tobacco were analyzed using the phylotype classification schemes.[Result]Phylogenetic analysis of endoglucanase gene sequences showed that all isolates belonged to phylotype I,including 4 different sequevars: 15,17,34 and 44.All of the 34 sequevar strains were collected from Fujian Province.Only 3 strains were identified as sequevar 44.Alighment analysis of amino acid sequences deduced from avrA gene could not distinguished Chinese R.solanacearum strains from the reference strain RS1000.[Conclusion]R.solanacearum strains on tobacco from Fujian and Guizhou had genetic differentiation to some degrees.

关 键 词:烟草 青枯菌 演化型 序列变种 内切葡聚糖酶基因 

分 类 号:S435.72[农业科学—农业昆虫与害虫防治]

 

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