水稻类受体蛋白激酶基因OsESG1的克隆与生物信息学分析  被引量:2

Cloning and Sequencing of A Receptor-like Protein Kinase Gene OsESG1 in Rice

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作  者:房孝良[1,2,3] 刘炜[1,2,3] 

机构地区:[1]山东师范大学生命科学学院,济南250014 [2]农业部黄淮海作物遗传改良与生物技术重点开放实验室,济南250100 [3]山东省农业科学院高新技术研究中心山东省作物遗传改良与生物技术重点实验室,济南250100

出  处:《生物技术通报》2012年第3期166-172,共7页Biotechnology Bulletin

基  金:国家自然科学基金项目(30870191);国家转基因植物新品种培育重大专项(2009ZX08001-010B);南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室开放基金项目(ZW2009001)

摘  要:类受体蛋白激酶(receptor-like protein kinase,RLK)在植物生长发育等多种信号的响应中发挥重要作用。以水稻基因组为模板,通过PCR方法,扩增到一条全长2.2 kb左右的目的片段,序列分析结合RT-PCR表明,该片段由一个完整的开放阅读框组成,无内含子,命名为OsESG1(GenBank登录号:HE 584611),其编码蛋白产物包含749个氨基酸残基。结构分析显示,该蛋白产物包含1个跨膜区、胞外S位点糖蛋白(SLG)、PAN_AP结构域和S_TKc结构域,属于S-结构域型类受体蛋白激酶,推测其在植物生殖发育过程中起作用。Receptor-like Protein Kinases(RLPKs)play key roles in developmental and signal transduction processes in higher plants.In this research,a 2.2 kb fragment named OsESG1(GenBank accession:HE 584611)was amplified using rice(Oryza sativa L.cv.Zhonghua 11)genomic DNA as template by PCR amplification.Sequence analysis and RT-PCR amplification all showed that this gene fragment included a coden sequence without any intron.The open reading frame of OsESG1 encoded a deduced protein OsESG1 of 749 amino acid residues,and the functional domains prediction showed that one transmembrane structure,one S_locus_glycop,one PAN_AP domain and one S_TKc domain were included in OsESG1,indicating that OsESG1 was a member of the S-domain subfamily of RLPKs.

关 键 词:水稻 类受体蛋白激酶 OsESG1基因 基因克隆 生物信息学分析 

分 类 号:S511[农业科学—作物学]

 

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