酵母蛋白网络的功能模块与关键蛋白研究  

Researching on functional modules and key protein in yeast protein network

作　　者：丁德武[1] 

机构地区：[1]池州学院数学与计算机科学系,安徽池州247000

出　　处：《计算机与应用化学》2012年第3期347-350,共4页Computers and Applied Chemistry

基　　金：安徽省教育厅自然科学项目(KJ2010B133)

摘　　要：蛋白交互网络在各种细胞功能和生命过程中发挥着至关重要的作用。对它的结构特征进行分析吸引了众多科研人员的关注,功能模块与关键蛋白的识别是其中的重要研究主题。本文主要使用模拟退火算法分析了酵母蛋白交互网络的功能模块,同时结合使用多种中心化指标识别了其中的关键蛋白,并讨论了这些功能模块和关键蛋白的生物学意义。Protein-protein interaction network （PPIN） plays an important role in cellular function and process. Structural analysis of PP1N has attracted so much attention, identification of functional modules and key protein are important topics in these research. Herein, we mainly identified the functional modules in yeast PPIN based on simulated annealing algorithm, and combinated several centrality measures for identifying its key proteins, with the discussion of biological signification about these functional modules and key proteins.

关 键 词：功能模块 蛋白交互网络 模拟退火算法 中心化 

分 类 号：TP339[自动化与计算机技术—计算机系统结构]