日本鼓虾线粒体基因组:真虾下目内部的基因重排与系统发育  

作　　者：申欣[1,2] 李晓[3] 沙忠利[2] 阎斌伦[1] 徐启华[1] 

机构地区：[1]淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点实验室,连云港222005 [2]中国科学院海洋研究所,青岛266071 [3]山东省花生研究所,青岛266100

出　　处：《中国科学：生命科学》2012年第7期595-602,共8页Scientia Sinica(Vitae)

基　　金：国家自然科学基金(批准号:40906067和31172054);中央财政支持地方高校发展专项基金(CXTD04);中国博士后科学基金(批准号:2012M510054);江苏省海洋生物技术重点实验室基金(批准号:2009HS12和2009HS13);青蓝工程人才基金(批准号:苏教师[2010]27)资助项目

摘　　要：在日本鼓虾线粒体基因组完成的基础上,结合现有线粒体基因组数据,全面揭示了真虾类线粒体基因组的基本特征.日本鼓虾线粒体基因组全长16487bp,包含37个基因,与后生动物线粒体基因组的标准基因组成一致.4个已完成的真虾类(罗氏沼虾、日本沼虾、沼虾Macrobrachium lanchesteri和夏威夷红虾)线粒体基因组的基因排列与泛甲壳动物的原始排列完全相同,过去曾经认为在真虾下目线粒体基因组中没有基因重排现象.然而,鼓虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnE)的易位和反转,这种基因排列方式在其他甲壳动物线粒体基因组中未见报道.同时,脊尾白虾线粒体基因组中存在1个转运RNA基因(trnP或trnT)的易位.分别统计了2种鼓虾(日本鼓虾和鲜明鼓虾)和3种沼虾(罗氏沼虾、日本沼虾和沼虾M.lanchesteri)13个蛋白质编码基因(PCGs)非同义替换与同义替换的比值(Ka/Ks),发现鼓虾和沼虾所有线粒体蛋白质编码基因的Ka/Ks均小于1,显示出强烈的纯化选择.基于线粒体基因组的系统发育分析结果,强烈支持长臂虾科和鼓虾科为单系群,并且其在科级的亲缘关系为:(长臂虾科+鼓虾科)+匙指虾科(BPM=100,BPP=100).

关 键 词：十足目 真虾下目 线粒体基因组 基因排列 系统发育 

分 类 号：S917.4[农业科学—水产科学]