几个地方鸡种MHCB-G座位克隆与生物信息学分析  

作　　者：屠云洁[1] 苏一军[1] 张学余[1] 李国辉[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院家禽研究所,江苏扬州225003

出　　处：《中国畜牧杂志》2012年第15期8-11,共4页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：江苏省自然科学基金(BK2010298);国家863子课题(2011AA100305);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-41);江苏省农业科技支撑项目(BE2010374)

摘　　要：本研究利用PCR和克隆测序方法,克隆新狼山鸡和仙居鸡MHC B-G基因全序列,分析序列的多态性并预测其蛋白质的结构与功能,为更好地保护地方鸡种提供基础资料。结果表明:分别获得新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G基因6 183 bp和6 415 bp全序列,与红色原鸡同源性达98%,3鸡种存在148个变异位点,为3个单倍型,单倍型多样度为0.07407,仙居鸡在4413-4661位置缺失249 bp;利用生物信息学预测新狼山鸡和仙居鸡MHCB-G蛋白,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点;新狼山鸡和仙居鸡有明显的跨膜螺旋结构,分别含有138个和98个磷酸化位点;MHC B-G基因具有丰富的遗传多样性,该MHC B-G蛋白可能是抗原位点的富集区,对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响。

关 键 词：MHC 克隆 生物信息学 鸡 

分 类 号：S831.2[农业科学—畜牧学]