初探E2F1对基因组内跨膜信号转导基因的调控作用  

Study on the E2F1 on Key Trans-membrane Signal Transduction Genes in Genome Regulation

作　　者：孙红梅[1] 马晔[1] 陈方[1] 徐良德[1] 

机构地区：[1]哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,黑龙江哈尔滨150081

出　　处：《现代生物医学进展》2012年第19期3614-3617,共4页Progress in Modern Biomedicine

基　　金：黑龙江省教育厅科学技术研究项目(12511273)

摘　　要：目的:从基因组全局性角度研究E2F1对包括离子通道和G蛋白偶联受体在内的重要的跨膜信号转导基因的调控作用。方法:对从TRED和IUPHAR获取的E2F1靶基因数据和基因组离子通道及G蛋白偶联受体基因数据进行数据联配,获取E2F1调控的离子通道基因(ICG)和G蛋白偶联受体基因,并对调控基因进行家族富集性分析和组织特异性分析。结果:发现E2F1对7个ICG具有调控作用,且具有钾离子通道富集性,调控的离子通道基因具有心脏、脑、消化系统组织表达特异性。获得的11个受E2F1调控的G蛋白偶联受体基因家族富集性不明显,组织特异性表达不一致。结论:E2F1可能通过对钾离子通道基因的表达调控,实现对相应组织的作用机理影响,相应调控作用的紊乱也将导致心脏、脑或消化系统疾病,但难以确定E2F1对GPCR的调控作用效果。Objective： Our study told about E2F1 regulation on the important trans-membrane transduction genes from the point of genome. Methods： We use TRED web service and IUPHAR database to realize E2F1 target genes, ion channel genes and G-protein-coupled receptor genes extraction. We achieve E2F1 regulation signal transduction genes by data alignment. Then, we introduce tissue-specific analysis and gene family enrichment analysis into the regulation data. Results： We find 7 ICG genes regulated by E2F1 significantly enrich in potassium ion channels, while these genes have a high heart, brain and digestive system tissue expression. E2F1 regulation of 11 GPCR genes did not show significant enrichment of family, and the tissue-specific expression is not clear. Conclusions： E2F1 maybe affect the cell physics such as cardiac muscle cell by the regulation of potassium channels, and lead to the heart, brain or digestive system diseases.

关 键 词：转录调控 离子通道 G蛋白偶联受体 组织特异性 富集分析 

分 类 号：Q75[生物学—分子生物学] Q811.4