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检 索 范 例 :范例一: (K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 范例二:J=计算机应用与软件 AND (U=C++ OR U=Basic) NOT M=Visual
作 者:周剑惠[1] 王爽[1] 魏雷雷[1] 吴静[2] 齐忠[3] 刘红[2] 苟伟民 陈创[5] 檀晓娟[6] 张勇[6] 张燕[6] 许文波[6]
机构地区:[1]吉林省疾病预防控制中心吉林省卫生厅病毒重点实验室,长春130062 [2]长春市疾病预防控制中心 [3]白城市疾病预防控制中心 [4]延边州疾病预防控制中心 [5]吉林市疾病预防控制中心 [6]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
出 处:《中华实验和临床病毒学杂志》2012年第4期273-275,共3页Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology
基 金:吉林省人社厅2010年度留学回国人员科技创新创业项目(2010-27);吉林省卫生厅2010年拔尖创新人才培养对象资助经费;科学技术部重大专项“传染病监测技术平台”(2009ZX10004-209);国家自然科学基金(30901259).
摘 要:目的分析引起吉林省2009--2010年手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)流行的肠道病毒71型的基因进化特征。方法选择31株2009-2010年分离于吉林省8个地市(州)HFMD病例的EV71代表株,对VP1编码区基因进行逆转录.聚合酶链反应扩增、扩增产物的序列测定,使用Bioedit软件和MEGA4.0软件对VP1基因进行同源性、基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2010年的31株EV71分离株均属于C4a基因亚型,3l株EV7t株在VP1区的核苷酸的同源性在94.5%~100%之间,分属于5个分支,其中25株病毒(分离于8个地市)形成一个大的分支,属于绝对优势传播链,其余6株形成4个小分支。结论2009-2010年在吉林省内有多个EV71C4a基因型的传播链同时存在,其中分支1为绝对优势传播链,在8个地市持续传播,引起HFMD的暴发流行。Objective To analyze the genetic characterization of enterovirus type71 ( EVTI ) associated with hand foot and mouth disease (HFMD) epidemics in Jilin province, during 2009-2010. Methods Randomly selected 31 representative EV71 strains from the cases of 8 prefectures to amplify and sequences of VP1 genes of EV71 strains, and analyzed with Bioedit and Mega4.0 program. Results All representative 31 EVT1 strains belong to C4a subgenotype, the homology of nucleotide in VP1 region among the 31 EV71 strains were 94. 5% -100. 0% , and were clustered into 5 transmission chains respectively. 25 strains out of 31 strains were associated with a predominant transmission chain, and circulating in 8 prefectures, while other 6 strains clustered into 4 lineages. Conclusion Multiple transmission chains of EVT71 C4a subgenotype were co-circulating in Jilin province during 2009-2010, and a predominant transmission chain was circulating in 8 prefectures, associated with HFMD outbreaks of Jilin province.
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