黄瓜根系蛋白质组分析的双向电泳技术条件优化  被引量:11

Optimization of Two-dimensional Electrophoresis for Proteome of Cucumber Root

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作  者:王珊珊[1] 郝宇涵[1] 任婧祺[1] 郭春深[1] 朱延殊[1] 范海延[1,2] 

机构地区:[1]沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110161 [2]沈阳农业大学设施园艺省部共建教育部重点实验室,沈阳110161

出  处:《沈阳农业大学学报》2012年第2期233-236,共4页Journal of Shenyang Agricultural University

基  金:国家自然科学基金项目(30700542);沈阳市科学技术基金项目(F10-205-1-04)

摘  要:双向电泳(2-DE)是蛋白质组学研究的重要支撑技术之一。为建立适于黄瓜根系蛋白质组分析的双向电泳技术,对黄瓜根系蛋白质样品提取方法、裂解缓冲液配方及SDS-PAGE分离胶浓度等参数进行研究。结果表明:采用TCA/丙酮法提取黄瓜根系中的蛋白质,裂解缓冲液为8mol·L-1尿素、2mol·L-1硫脲、2%IPG Buffer、4%CHAPS、1%TBP、65mmol·L-1DTT、2mmol·L-1EDTA、0.001%溴酚蓝和1%鸡尾酒,SDS-PAGE分离胶浓度为11%时,可获得分离效果较好的双向电泳图谱。该技术条件为适合黄瓜根系蛋白分离的较优双向电泳体系。Two-dimensional electrophoresis(2-DE) is known as the most effective as well as one of the simplest methods for separating proteins.To obtain suitable 2-DE protocol for cucumber root,the method of protein extraction,reagent of lysis buffer and concentration of the second-dimensional SDS separation gel were optimized.Results showed TCA/acetone protein extraction method,8mol·L-1 Urea,2mol·L-1 Thiourea,2% IPG buffer,4% CHAPS,1% TBP,65mmol·L-1 DTT,2mmol·L-1 EDTA,0.001% Bromophenol blue and 1% Cock tail lysis buffer and 11% gel concentration were appropriate for the sample preparation of cucumber root.

关 键 词:黄瓜根系 蛋白质组 双向电泳 

分 类 号:S642.2[农业科学—蔬菜学]

 

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