鳡鱼ISSR-PCR反应体系的正交优化  

Optimization for ISSR Reaction System of Yellowcheek Carp Elopichthys bambusa by Orthogonal Design

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作  者:温树红[1] 马云霞[1] 杨太有[1] 周真真[1] 

机构地区:[1]河南师范大学生命科学学院,河南新乡453007

出  处:《水产科学》2012年第10期620-623,共4页Fisheries Science

基  金:河南省教育厅自然科学研究项目(2010B240002);河南省动物重点学科资助项目

摘  要:利用正交试验设计的方法,对鳡鱼ISSR-PCR反应体系中的Mg2+浓度、引物浓度、dNTPs浓度、DNA模板浓度及Taq DNA聚合酶浓度进行优化分析。建立了最佳ISSR-PCR反应体系,即25μL反应体系中含Mg2+2mmol/L、引物0.4μmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、模板DNA 100ng、Taq DNA聚合酶1.0U。并在此基础上对退火温度和循环次数进行梯度试验,得到最佳退火温度为52℃,最佳循环次数35次。The orthogonal design was used to optimize ISSR-PCR system of yellowcheek carp Elopichthys bambusa in five factors(Mg2+,primer,dNTPs,DNA template and Taq DNA polymerase).The optimized ISSR-PCR system(25 μL) was established under Mg2+ 2.0 mmol/L,primer 0.4 μmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,DNA template 100 ng and Taq polymerase 1.0 U.Then,annealing at 52 ℃ and 35 cycles were found to be optimal in the optimized ISSR-PCR system.

关 键 词:鳡鱼 ISSR 正交设计 

分 类 号:Q951[生物学—动物学]

 

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