乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析  

Identification and Bioinformatic Analyses of Metastasis Related Genes in Breast Cancer

作　　者：余海浪[1] 夏晓燕 丁大鹏[1] 周珏宇[1] 郑文岭[3] 马文丽[1] 

机构地区：[1]南方医科大学基因工程研究所,广州510515 [2]广州市妇女儿童医疗中心,广州510623 [3]华南基因组研究中心,广州510800

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》2012年第11期1069-1074,共6页Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology

基　　金：广东省医学科研基金(No.B2012203);广东省领军人才专项基金(No.C1030925)~~

摘　　要：乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,转移与复发是乳腺癌患者死亡的主要原因.研究与乳腺癌细胞转移相关的分子靶点对预防乳腺癌术后复发、提高疗效有重要意义.本研究以3组乳腺癌转移相关的基因表达谱数据(GSE2034,GSE2603,GSE12276)为分析材料,采用GeneSpring软件筛选乳腺癌原发瘤与转移瘤芯片数据的差异表达基因,结合生物信息学工具PATHER、STRING、pSTIING和文献挖掘工具iHOP对差异基因及其相互作用关系进行分析.结果显示,共筛选出乳腺癌转移共同差异基因147个,其中表达上调93个,表达下调54个.这些差异基因主要涉及细胞周期与增殖、细胞粘附、细胞迁移、血管形成及信号转导等生物通路和生物过程.差异基因编码蛋白间的相互作用主要集中在14个蛋白,且在更为复杂的网络图谱中仍可见其中9个基因(CXCR4、MMP1、MMP2、MMP3、CTGF、COL1A1、MEF2C、PTGS2及SPARC)在重要的节点位置.文献挖掘发现,COL1A1基因可能为新发现的乳腺癌转移候选基因,为乳腺癌转移的发病机制提供新的思路,也为转移性乳腺癌的分子诊断和个体化治疗奠定基础.

关 键 词：乳腺癌 转移 基因 生物信息学 

分 类 号：Q5[生物学—生物化学] Q7