4种血清型登革病毒NS1蛋白序列及B细胞抗原表位特异性分析  被引量:3

Analysis on genome and amino acids sequence and B cell epitopes for 4 serotypes of dengue virus NS1 protein

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作  者:陈艳佳[1] 熊建英[1] 朱利[1] 曹虹[1] 赵卫[1] 

机构地区:[1]南方医科大学公共卫生与热带医学学院中心实验室,广州510515

出  处:《现代预防医学》2013年第1期117-120,123,共5页Modern Preventive Medicine

基  金:国家自然科学基金资助项目(U1132002);广州市科技计划项目(2008Z1E4011);新发传染病防治广东普通高校重点实验室基金(KLB09007)

摘  要:目的比较4种血清型登革病毒NS1蛋白型特异性抗原表位基因序列及氨基酸序列之间的差异,为利用基因差异进行血清学分型及疫苗研究提供新的线索。方法利用DNAstar数据包中的Editseq程序,从20株登革病毒分离株的全基因组序列中将NS1基因型特异性抗原表位序列截取出来,再用ClustalX软件进行多序列比对,进行同源性分析,找出型内最为保守的抗原表位序列。并将比对结果在120株登革病毒序列中进一步验证。结果 NS1蛋白36~45和71~85位氨基酸为型特异性抗原表位,高度保守,型内完全相同,型间不同。结论 NS1蛋白36~45位氨基酸可以作为登革病毒血清分型和研制亚单位疫苗的靶标。OBJECTIVE To compare genome and amino acids sequences and possible B cell epitopes of 4 serotypes of dengue virus NS1 protein, to explore a new method of gene typing and provide new clues to vaccine research. METHODS Cut off the corresponding gene sequences of NS1 protein from the complete genome of 20 dengue virus isolates, then multisequencing was carried out to find the gene which was conservative within the same serotype and variant in the other serotypes. RESULTS Spe- cific antigens of NS1 protein (36-45 and 71-85 amino acids) were conservative within the same serotype and variant in other serotypes. CONCLUSION Specific antigens of NS1 protein (36-45 amino acids) are the bases of dengue virus typing and tar- gets of subunit vaccine development.

关 键 词:登革病毒 NS1蛋白 抗原表位 

分 类 号:R373.33[医药卫生—病原生物学]

 

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