利用16S rRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法分析肉牛瘤胃上皮细菌群落特征  

作　　者：Li M 赵圣国 

出　　处：《中国畜牧兽医》2013年第1期84-84,共1页China Animal Husbandry & Veterinary Medicine

摘　　要：目前对于附着于瘤胃上皮的细菌群落及其功能了解较少,本研究目的是利用16SrRNA测序、PCR-DGGE和qRT-PCR方法比较分析肉牛瘤胃上皮与瘤胃内容物细菌群落的多样性差异。从6个16SrDNA(～1.4kb)文库中随机选取2785条序列,结果表明3个瘤胃内容物文库与3个瘤胃上皮文库的细菌群落存在差异。以97%的序列相似度进行计算,结果发现瘤胃内容物菌群文库的多样性指数(4.12/4.42/4.88)比瘤胃上皮组织菌群文库的多样性指数(2.90/2.73/3.23)高。厚壁菌门和拟杆菌门分别是瘤胃上皮组织和内容物的优势菌群,纤维杆菌门、浮霉菌门和疣唯菌门仅在瘤胃内容物中存在。通过PCR-DGGE对22头阉牛瘤胃内容物和瘤胃上皮的细菌群落分析,进一步证实瘤胃上皮栖息着一类以厚壁菌为主的独特菌群,这类菌不仅具有消化饲料的作用,还有其他未知功能。

关 键 词：瘤胃细菌多样性 变形梯度凝胶电泳 16S rRNA序列分析 菌群比较 

分 类 号：S858.31[农业科学—临床兽医学]