红藻条斑紫菜变藻蓝蛋白晶体结构的分子置换法研究  

作　　者：刘锦玉[1] 江涛[1] 张季平[1] 常文瑞[1] 梁栋材[1] 

机构地区：[1]中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室,北京100101

出　　处：《中国科学（C辑）》2000年第3期289-293,共5页Science in China(Series C)

基　　金：国家自然科学基金!(批准号:39630090);中国科学院重大基金!(批准号:KZ85-04-40)

摘　　要：以蓝藻钝顶螺旋藻（Ｓｐｉｒｕｌｉｎａ ｐｌａｔｅｎｓｉｓ）变藻蓝蛋白（ＡＰＣ－ＳＰ）的晶体结构为搜索模型，运用 ＡＭｏＲｅ程序，对红藻条斑紫菜（Ｐｏｒｐｈｙｒａ ｙｅｚｏｅｎｓｉｓ）变藻蓝蛋白（ＡＰＣ－ＰＹ）的晶体结构进行了分子置换法研究．ＡＰＣ－ＰＹ晶体（晶型３）属Ｒ３２空间群，晶胞参数为ａ＝ｂ＝ １０．５３ ｎｍ， ｃ＝ １８．９４ ｎｍ， α＝β＝９０°，γ＝ １２０°．在单位晶胞的每个结晶学不对称单位中含一个αβ单体．在获得交叉函数解的基础上，进行了平移函数搜索，给出了Ｃ_ｃ值和Ｒ因子分别为６７％和３６．１％的最佳平移解．所得分子置换法的结果被用于ＡＰＣ－ＰＹ初始结构模型的构建和结构精化，经一系列 ２Ｆ_ｏ－Ｆ_ｃ ＯＭＩＴ图的综合验证分析，进一步证实了所得分子置换法解的正确性．

关 键 词：变藻蓝蛋白 分子置换法 晶体结构 红藻条斑紫菜 

分 类 号：Q518.2[生物学—生物化学]