青藏高原湖泊沉积物硫酸盐还原菌种群分布  被引量:6

Abundance and Diversity of Sulfate-reducing Bacteria in Qinghai-Tibetan Lakes

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作  者:杨渐[1,2,3] 蒋宏忱[2] 孙永娟[1] 吴耿[2] 侯卫国[4] 董海良[2,4] 赖忠平[1,5] 

机构地区:[1]中国科学院青海盐湖研究所,青海西宁810008 [2]中国地质大学(武汉),生物地质与环境地质国家重点实验室,湖北武汉430074 [3]中国科学院大学,北京100049 [4]中国地质大学(北京),生物地质与环境地质国家重点实验室,北京100083 [5]中国科学院寒区旱区环境与工程研究所,甘肃兰州730000

出  处:《盐湖研究》2013年第1期7-13,共7页Journal of Salt Lake Research

基  金:国家自然科学基金青年科学基金项目(41002123);国家自然科学基金重点项目(41030211);国家自然科学基金创新群体项目(41121001)

摘  要:采用聚合酶链式反应(PCR,Polymerase Chain Reaction)、变性梯度凝胶电泳(DGGE,Denaturing Gra-dient Gel Electrophoresis)与实时荧光定量聚合酶链式反应(Q-PCR,Quantitative PCR)相结合的综合分析技术,研究了青藏高原洱海、青海湖、尕海1、尕海2、小柴旦湖沉积物硫酸盐还原菌多样性及丰度。研究结果显示,5个盐湖沉积物中dsrB(编码亚硫酸还原酶β亚基,为硫酸盐还原菌所共有)基因的丰度为每克沉积物1.71×108~1.55×109拷贝,与盐度无明显相关性;所获得的dsrB基因序列分属于3个科:Desulfobacter-aceae,Desulfobulbaceae和Peptococcaceae。其中,Desulfobacteraceae科是主要类群。硫酸盐还原菌多样性(DGGE结果)与盐度呈现出负相关性。故在所研究的盐湖中,盐度可能不是影响硫酸盐还原菌种群分布的唯一因素,可能还受其它未知环境因素的影响,有待于进一步研究。The abundance and diversity of sulfate-reducing bacteria in sediments collected from six lakes (Erhai Lake, Qinghai Lake, Gabail Lake, Gahai2 Lake, Xiaochaidan Lake, and East Dabsan Lake) on Qinghai-Tibet Plateau were investigated by using an integrated approach including polymerase chain reac- tion( PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), and quantitative PCR (qPCR). The re- suits show that the dsrB gene ( encoding for ~3-subunit of the dissimilatory sulfite reductase) abundance in the studied saline lakes ranges from 1.71 x l0s to 1.55 x 109 copies per gram of sediments, which did not show apparent relationship with salinity; The retrieved DGGE band sequences were affiliated with Desul- fobacteraceae, Desulfobulbaceae and Peptoeoccaceae, and Desulfobacteraceae sequences were dominant. The DGGE-based dsrB gene diversity decreased as salinity increase. Taken together, salinity may not be the sole factor controlling the abundance and diversity of sulfate reducing bacteria in Qinghai-Tibetan lakes, but other unknown environmental factors may contribute, which awaits further investigation.

关 键 词:dsrB基因 DGGE 硫酸盐还原菌 青藏高原湖泊 

分 类 号:Q939.99[生物学—微生物学]

 

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