毛果杨全基因组ANK基因的鉴定及表达分析  

Genome-wide identification and expression analysis of ANK gene family in Populus trichocarpa

作　　者：龙甜甜[1] 张红梅[1] 王婕[1] 项艳[1] 

机构地区：[1]安徽农业大学林学与园林学院,合肥230036

出　　处：《安徽农业大学学报》2013年第2期210-218,共9页Journal of Anhui Agricultural University

基　　金：国家科技支撑计划子课题(2009BADA6B006-1)资助

摘　　要：锚蛋白重复序列(ankyrin repeats)是普遍存在于生物体中的介导蛋白与蛋白相互作用的一种结构域。具有这种结构域的蛋白参与转录的启动、细胞周期的调控、细胞骨架系统的形成及离子的运输和信号转导。利用生物信息学方法,以杨树最新基因及蛋白序列为基础,通过对毛果杨全基因组中ANK基因的鉴定,获得较为完整的ANK家族信息。同时,对该家族成员的分类、进化、定位、结构和表达进行全面分析,为下一步研究ANK基因的功能提供重要的生物信息依据。The ankyrin repeat（ANK） is one of the most common structure motifs mediating protein to protein interaction.The repeat found in proteins participated in transcriptional initiation,cell cycle regulation,cytoskeletal,ion transportion and signal transduction.Based on the latest genome protein sequences of poplar,ANK genes and comparatively complete gene family information were obtained by bioinformatics methods.Subsequently,classification,phylogenetic analysis,chromosomal localization,gene structure analysis and gene expression pattern analysis were also investigated.These results provide an important clue for functional study of ANK genes.

关 键 词：杨树 ANK 表达 生物信息学 

分 类 号：S792.11[农业科学—林木遗传育种]