北京市西城区2009年-2011年H3N2甲型流感病毒HA1基因特性分析  被引量:4

Gene analysis of HA1 of A influenza virus H3N2 in Xicheng district,Beijing

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作  者:张晶波[1] 张家淮[2] 胡晓芬[1] 李达[1] 苗芳[1] 王永全[1] 吉彦莉[1] 

机构地区:[1]北京市西城区疾病预防控制中心,北京100120 [2]首都医科大学右安门临床检验中心,北京100069

出  处:《中国卫生检验杂志》2013年第3期661-663,共3页Chinese Journal of Health Laboratory Technology

基  金:北京市优秀人才资助项目资助(20081D0900700294)

摘  要:目的:了解2009年6月-2011年6月期间北京市西城区H3N2甲型流感病毒HA1基因的变异情况。方法:采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增分离到的H3N2甲型流感病毒HA1基因,对基因片段进行测序,获得的序列与WHO推荐的疫苗株进行基因进化特性分析。结果:HA1基因进化树分析表明2009年、2010年、2011年基本上分为三个分支,并且每个分支与当年的疫苗株都不在同一分支上;HA1氨基酸变异中,抗原决定簇约有10.6%发生了变化,受体结合位点194位有改变。结论:2009年-2011年北京市西城区分离到的H3N2亚型流感病毒的抗原性及基因特性发生了变化,这种变化与世界各地的变化趋势大体吻合。Objective:To analyze the genetic characteristics of influenza A(H3N2) virus during 2009 -2011 in Xicheng district of Beijing. Methods: HA1 gene of A(H3N2) virus was isolated with reverse transcription - polymerase chain reaction( RT - PCR) and sequenced for gene evolution characteristics analysis with vaccine strains recommended by WTO. Results: HA1 gene phylogenetic tree analysis showed there were three branches in 2009, 2010 and 2011 respectively, and each branch had no homology with the vaccine strains of the same year. HA1 amino acid variation was performed with changes on 10.6% of the antigen epitope and receptor - binding site 194. Conclusion : From 2009 to 2011, the antigenicity and gene characteristics of A(H3N2) virus isolates had changed in Beijing, the same is true around the world

关 键 词:H3N2甲型流感病毒 HA1基因 基因序列分析 

分 类 号:R373.13[医药卫生—病原生物学]

 

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