二维分子动力学程序(MDP)的并行与优化  

PARALLELIZATION AND OPTIMIZATION FOR A TWO DIMENSIONAL MOLECULAR DYNAMICS CODE(MDP)

作　　者：莫则尧[1] 张景琳[1] 

机构地区：[1]北京应用物理与计算教学研究所计算物理实验室,北京100088

出　　处：《计算物理》2000年第1期193-198,共6页Chinese Journal of Computational Physics

摘　　要：基于消息传递并行程序设计平台MPI ,结合当前微处理器的高性能特征 ,探讨了二维分子动力学数值模拟程序的优化和并行 ,且具体应用到高速碰撞物理模型问题。其中 ,串行优化的性能提高了两倍 ,并行效率在由 8台高性能微机构成的微机机群上 ,均大于 90 %。On the basis of the message passing parallel programming platform MPI,and with the high performance characteristics of contemporary microprocessors,it describes the parallelization and optimization for a two dimensional molecular dynamics code(MDP) to simulate the high speed collision physical model problems.The serial optimization has shown to be of double performance improvements,and the parallel efficiencies being above 90% under the cluster consisted of 8 Pentium\|Ⅱ microprocessors. [

关 键 词：分子动力学 优化 并行计算 MDP 

分 类 号：O552[理学—热学与物质分子运动论] O242[理学—物理]