线粒体全基因组测序探寻高原环境对Artemia tibetiana和A．urmiana卤虫种线粒体基因的影响  

作　　者：张航晓[1,2] 罗奇斌 孙婧[1,2] 刘飞[1,2] 吴刚[1,2] 于军[1] 王伟伟[1,4] 

机构地区：[1]中国科学院北京基因组研究所基因组学及信息重点实验室,北京101300 [2]中国科学院大学,北京100094 [3]Department of Genorne Oriented Bioinformatics, Technische Universitat MUnchen, Wissenschaftszentrum Weihenstephan, 85350 Freising,Germany [4]Division of Gastroenterology, Department of Medicine, University of Alberta, Edmonton, T6G 2V2, Alberta, Canada

出　　处：《中国科学：生命科学》2013年第4期319-331,共13页Scientia Sinica(Vitae)

基　　金：国家自然科学基金(批准号:30221004);国家重点基础研究发展计划(批准号:2011CB944100)资助项目

摘　　要：卤虫(Artemia)属甲壳纲无背甲目,生活于高盐环境中,低海拔和高海拔地区均有分布,在适应不同环境需求的过程中形成了遗传的多样性.为研究卤虫表型的可塑性,本研究对2个来自青藏高原的A.tibetiana和1个来自伊朗乌尔米耶湖的A.urmiana的线粒体进行了全基因组测序,将获得的3个序列信息与另一低海拔平原上的卤虫种A.franciscana进行比较分析.在线粒体蛋白编码基因的序列比对中发现:A.franciscana和A.tibetiana/A.urmiana组间atp8基因的Ka/Ks值最高,而A.tibetiana和A.urmiana组间,atp6基因的Ka/Ks值最高.鉴于A.tibetiana和A.urmiana遗传距离较近,但分别分布于高海拔和低海拔,环境差异显著,提示在高原环境适应过程中atp6基因可能受到强的选择压力.在D-loop区鉴别到2个延长终止相关的序列(ETASs)和3个保守序列块(CSBs),猜测D-loop或者呼吸链亚基的序列变化,可单独或共作用促进卤虫适应不同海拔环境.

关 键 词：线粒体基因组 ARTEMIA tibetiana序列变化 高原物种 

分 类 号：Q958[生物学—动物学]