不同植物TAT基因完整编码区生物信息学分析  

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作  者:李慧娥[1] 郭其强[1] 刘柳[2] 兰小中[1] 

机构地区:[1]西藏农牧学院,西藏林芝860000 [2]陕西师范大学食品工程与营养科学学院,陕西西安710062

出  处:《江苏农业科学》2013年第5期20-23,共4页Jiangsu Agricultural Sciences

基  金:国家自然科学基金(编号:31260189);旱区作物逆境生物学国家重点实验室开放基金(编号:CSBAA2011-05);国家科技支撑计划(编号:2011BAI13B06);211工程师资队伍建设项目(编号:SZRC-211-14)

摘  要:采用生物信息学方法,以已有文献报道的拟南芥、罂粟、彩叶草及丹参这4种植物7种酪氨酸转氨酶(TAT)编码序列为研究对象,对其进行核苷酸序列及推导氨基酸序列特征分析。结果表明,7种TAT没有明显亲水/疏水区域,属非跨膜不稳定蛋白,不存在信号肽,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,定位于叶绿体及细胞质中,有TAT保守结构域,三级结构也较保守。通过对已报道植物TAT的生物信息学预测和分析,为其他植物未知TAT克隆及功能研究提供理论参考依据。

关 键 词:酪氨酸转氨酶 生物信息 次生代谢 

分 类 号:Q558[生物学—生物化学]

 

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