牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究  

作　　者：杨永强[1] 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷[1] 谢海强[1] 刘若余[1] 

机构地区：[1]贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳550025 [2]贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳550001

出　　处：《中国畜牧杂志》2013年第11期9-13,共5页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：贵州省重大科技专项计划项目(黔科合重大专项字[2011]6009号)

摘　　要：为筛选CIS基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明:CIS基因5′调控区3个SNPs位点,分别为G-726A、C-669T、C-82G;生物信息学软件预测得到CIS基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生;多态性位点对转录因子结合位点、RNA二级结构稳定性均有显著影响,但并不改变CpG岛大小。

关 键 词：CIS SNP 启动子 贵州荷斯坦奶牛 务川黑牛 

分 类 号：S823.2[农业科学—畜牧学]