木薯苹果酸脱氢酶基因克隆和表达分析  被引量:4

Cloning and Expression Analysis of Malate Dehydrogenase Gene from Cassava

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作  者:尹奇[1,2] 仝征[2] 贺庭琪[1,2] 王力敏[1,2] 黄启星[2] 郭运玲[2] 孔华[2] 王旭初[1,2] 郭安平[2] 

机构地区:[1]海南大学农学院,海南海口570228 [2]中国热带农业科学院热带生物技术研究所,海南海口571101

出  处:《热带作物学报》2013年第6期1082-1089,共8页Chinese Journal of Tropical Crops

基  金:国家重点基础研究发展973计划(No.2010CB126605);中国热带农业科学院热带生物技术研究所基本科研业务费专项(No.ITBB110101;No.ITBB110102);海南省自然科学基金(No.310080)

摘  要:为从木薯块根中获得苹果酸脱氢酶(MDH)基因,并研究其在转录水平的表达变化规律,利用RACE技术从木薯"华南8号"块根中克隆得到了苹果酸脱氢酶基因,其cDNA全长1 175 bp,包含999 bp的开放阅读框,共编码332个氨基酸。从木薯"华南8号"中获得的MDH氨基酸序列,与其它物种的该序列相似度达84%-94%,包含细胞质苹果酸脱氢酶中高度保守的NAD结合基元"TGAAGQI"和催化基元"IWGNH"。木薯MDH基因与块根淀粉合成相关,在块根发育前期表达量较低,膨大期表达量较高,膨大后期表达量逐渐降低。A 1 175 bp cDNA sequence of MDH with a 999 bp open reading frame, encoding a protein with 332 amino acids, was obtained from cassava SC8 roots by RACE (rapid-amplification of eDNA ends) to study the expressional pattern of malate dehydrogenase (MDH) mRNA. The MDH shared 84%-94% of amino acid sequence identities with MDH from other species, and contained a typical NAD~ binding motif (TGAAGQI) and a catalytic motif (IWGNH), suggesting it was a cytosolic malate dehydrogenase (cyMDH) gene. MDH was perhaps involved in the process of starch accumulation in cassava, the expression of cassava MDH was up regulated during storage root thinckening.

关 键 词:木薯 块根 苹果酸脱氢酶 淀粉合成 

分 类 号:S533[农业科学—作物学]

 

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