GSAS:针对基因序列的集成分析系统  

GSAS:an integrative analysis system for sequence

作　　者：黄钰[1] 李平[1] 李儒苗[1] 魏小梅[1] 胡滨[1] 王建勇[1] 

机构地区：[1]华中农业大学理学院,武汉430070

出　　处：《华中农业大学学报》2013年第4期143-148,共6页Journal of Huazhong Agricultural University

基　　金：中央高校基本科研业务费专项(2012ZYTS021);国家自然科学基金项目(61202304/F020606);湖北省自然科学基金一般项目(2012FFB02801)

摘　　要：以J2EE环境为基础构建1个基于工作流的基因序列分析系统GSAS(gene sequence analysis system),该系统提供统一的数据、算法接口和可视化的图形界面,集成多种关键的序列分析算法和工具,同时实现异构数据的整合。GSAS所采用的工作流机制为基因序列分析领域提供了协作研究的解决方案。In analyzing gene sequences,various heterogeneous data analysis and a variety of software and algorithms should be integrated.The interactive graphical interface is a prerequisite.A software system named GSAS（gene sequence analysis system） based on Java-based J2EE environment was proposed.The system provides a unified data,algorithm interface and visualization graphical interface,not only integrates a variety of key sequence analysis algorithms and tools,but also achieves the integration of heterogeneous data.The workflow mechanism of GSAS provides a collaborative study solution for analyzing gene sequence.

关 键 词：基因序列 序列分析 接口 集成 软件系统 

分 类 号：TP311.52[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]