2008-2009年北京地区GⅡ.12型诺如病毒基因特征研究  

Genetic Characterization of G Ⅱ.12 Norovirus in Beijing from 2008 to 2009

作　　者：陈克娜[1] 田耕[2] 靳森[3] 李慧莹[3] 李全瑞[2] 康利红[2] 张翠红[3] 孔翔羽[3] 高基民[1] 段招军[3] 

机构地区：[1]温州医科大学,浙江317500 [2]首都医科大学宣武医院 [3]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所

出　　处：《中华实验和临床病毒学杂志》2013年第3期184-186,共3页Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology

基　　金：国家自然科学基金项目，"十一五"国家科技重大专项

摘　　要：目的 了解2008-2009年北京地区成人腹泻样本中诺如病毒（Norovirus,NoV）GⅡ.12型毒株的基因特征.方法 用三对引物对11株GⅡ.12型诺如病毒毒株RdRp,、ORF2、ORF3及ORF1/OFF2重叠区分别扩增,PCR产物纯化、克隆、测序,通过DNAStar、MEGA、SimPlot等生物软件进行比对、系统进化分析及重组分析.结果 根据系统进化分析,11株在RdRp区属于GⅡ.g,在ORF2和ORF3区均属于GⅡ.12.SimPlot分析进一步证实了11株均为GⅡ.g/GⅡ.12重组株.结论 北京地区流行的GⅡ.12型诺如病毒与世界其他地区流行的GⅡ.12型诺如病毒毒株均属同一毒株,确定了北京地区GⅡ.12型诺如病毒毒株的基因特征.Objective To reveal the genetic characteristics of G Ⅱ.12 Norovirus strains isolating from stool samples of adults with diarrhea in Beijing during 2008-2009.Methods RdRp,ORF2,ORF3 and ORF1/ORF2 overlap region were respectively amplified by primers using RT-PCR.The products were purified,cloned,sequenced and then aligned,phylogenetie and recombinant analyzed by softwares of DNAStar,M EGA and SimPlot.Results According to the phylogenetic analysis,11 strains belonged to G Ⅱ.g in the RdRp region,while GⅡ.12 in the ORF2 and ORF3.SimPlot analysis further confirmed the 11 strains were recombinant strains （G Ⅱ.g [RdRp]/G Ⅱ.12 [capsid]）.Conclusion G Ⅱ.12 Norovirus prevailing in Beijing and other regions of the world belonged to the same strain,and we identified the genetic characteristics of G Ⅱ.12 Norovirus in Beijing.

关 键 词：诺如病毒 腹泻 胃肠炎 重组 遗传 

分 类 号：R51[医药卫生—内科学]