一株鸭源H3N6亚型禽流感病毒遗传进化分析  

Phylogenic Analysis of an H3N6 Avian Influenza Virus Isolated from Duck

作　　者：曹蓝[1,2] 焦培荣[1,2] 宋亚芬[1,2] 龚浪[1,2] 袁润余[1,2] 韦良孟[1,2] 亓文宝[1,2] 廖明[1,2] 

机构地区：[1]华南农业大学兽医学院,广东广州510642 [2]人兽共患病防控制剂国家地方联合工程实验室、农业部兽用疫苗创制重点实验室、广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广东广州510642

出　　处：《动物医学进展》2013年第7期17-24,共8页Progress In Veterinary Medicine

基　　金：国家肉鸡产业技术体系项目(nycytx-42-G3-03);广东省自然科学基金项目(10251064201000004);国家自然基金项目(31172343);广东省科技计划项目(2012B020306003,2010B020307005);2010年度广东省高等学校高层次人才项目

摘　　要：从活禽交易市场健康鸭体内分离到一株H3N6亚型禽流感病毒,命名为A/Duck/Guangdong/E9/2012(H3N6),这是该亚型禽流感病毒在我国广东地区的首次分离报道。为分析其遗传进化特征,对该病毒全基因组序列进行了测定,进行了遗传进化分析。结果显示,其HA裂解位点附近的氨基酸序列为PE-KQTR↓GLF,只含有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的HA裂解位点氨基酸序列的分子特征;其HA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7457/2011(H3N5)禽流感病毒的HA基因同源性最高,其NA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7438/2011(H4N6)禽流感病毒的NA基因同源性最高。全基因组分子遗传进化分析结果显示,其8个基因均属于欧亚谱系的禽源进化分支。An H3N6subtype avian influenza virus（AIV）[A/Duck/Guangdong/E9/12（H3N6）]was isolated from in duck a live bird market in Southern China in 2012,which was the first report that such subtype AIV was isolated in Guangdong province.The sequence analysis of the hemagglutinin（HA）gene showed that the virus was categorized to be a low pathogenic AIV,with a cleavage site of PEKQTR↓GLF.The HA gene has the highest homology with HA gene of A/Duck/Mongolia/OIE-7457/2011（H3N5）AIV isolated from Mongolia in 2011.The NA gene was closely related to that of A/Duck/Mongolia/OIE-7438/ 2011（H4N6）AIV isolated from Mongolia in 2011.The phylogenic analysis indicated that the eight genes of this isolate belong to the Eurasian avian lineage.

关 键 词：禽流感病毒 H3N6 基因组序列分析 分子遗传演化 

分 类 号：S852.659.5[农业科学—基础兽医学] Q789[农业科学—兽医学]