丹参锚蛋白重复序列家族基因的克隆和表达分析  

Cloning and expression analysis of SmARP from Salvia miltiorrhiza

作　　者：张璇[1] 库里满·恰里甫[1] 武玉翠[1] 王喆之[1] 

机构地区：[1]陕西师范大学药用资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西西安710062

出　　处：《陕西师范大学学报（自然科学版）》2013年第4期63-66,共4页Journal of Shaanxi Normal University：Natural Science Edition

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31000134);陕西省科技研究发展攻关计划(2006K16-G15)

摘　　要：用降落PCR的方法获得了丹参锚蛋白重复序列家族基因(SmARP).生物信息学显示,SmARP所编码蛋白的分子质量为19,064kD,理论等电点为8.4,是一种不稳定而且无信号肽和无跨膜区域的蛋白.该蛋白的二级结构中主要存在α螺旋(39.64%)和无规卷曲(42.01%),其三维结构模型中每个锚蛋白重复序列折叠成两个反向平行的α-螺旋,每两个α-螺旋中间形成一个长环.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在丹参的根、茎、叶、花中均有表达.An ankyrin repeat family protein gene（SmARP）from Salvia miltiorrhiza was cloned using TD-PCR. Bioinformatics analysis showed that the calculated molecular mass is 19,064 kD, and the theoretical isoelectric point is 8. 4. Ankyrin repeat protein in S. miltiorrhiza is an unstable protein without signal peptide and transmembrane segments. Predicted secondary structure of SrnARP contain, alpha helix（ 39. 640% ）and random coil （42. 01%）. The three dimensional structure model of SrnARP showed that each repeat folds into two antiparallel α- helices followed by a long loop. The real-time PCR results showed SrnARP expresses in roots, stems,leaves and flowers of S. rniltiorrhiza.

关 键 词：丹参 锚蛋白重复序列家族基因 生物信息学分析 

分 类 号：Q517[生物学—生物化学] Q943.2