獐牙菜亚族植物DNA条形码研究  

DNA barcoding of plants of Swertiinae

作　　者：孙瑶[1,2] 郗厚诚[1,2] 薛春迎[2] 

机构地区：[1]中国科学院大学,北京100049 [2]中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理重点实验室,昆明650201

出　　处：《华中师范大学学报（自然科学版）》2013年第4期551-557,共7页Journal of Central China Normal University：Natural Sciences

基　　金：国家自然科学基金项目(31170194);中华人民共和国科学技术基础性工作专项(2011FY120200)

摘　　要：为准确鉴定獐牙菜亚族植物(包含常用藏药"蒂达"(藏茵陈))的基原植物,实现对贮藏药材的标准化鉴别.本研究利用核基因ITS片段和叶绿体rbcL、mat K和trnH-psbA片段对獐牙菜亚族25种50个个体进行DNA条形码研究,结合4个候选条形码及其组合的种内、种间距离分布及物种鉴别率评价其在獐牙菜亚族植物中的应用效果.结果表明:核基因ITS片段不仅在单片段中鉴别率最高(80%),包含ITS片段的候选条形码组合的物种鉴别率均为100%,考虑mat K+ITS组合对种子植物的物种鉴别效果更好,推荐双条形码组合mat K+ITS为獐牙菜亚族植物的标准条形码.The identification of plants of subtribe Swertiinae （Gentianaceae） holds im- portance in that many plants of Swertiinae are used as material for Tibetan medicine ＂Dida＂ （Zangyinchen）. In order to provide accurate identification of these plants, we evaluate the performance of 4 candidate barcodes （nuclear ITS, chloroplast rbcL,matK and trnH-psbA） in 50 individuals of 25 species of Swertiinae. The result shows that ITS not only perform best（80%）among 4 individual barcode; any barcode used in combination with ITS receive 100% species identification rate. Take the high discrimination power of matK ＋ ITS in seed plants into consideration, we recommend matK＋ ITS combination as the standard barcode combination for plants of Swertiinae.

关 键 词：DNA条形码 獐牙菜亚族 TRNH-PSBA ITS MATK RBCL 

分 类 号：Q959.7[生物学—动物学]