新一代焦磷酸测序平台在HIV/AIDS研究中的应用  

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作  者:郝伟明[1] 徐庆刚[1] 张春霞[1] 张驰宇[1,2] 

机构地区:[1]江苏大学生命科学研究院,镇江212013 [2]中国科学院上海巴斯德研究所病原诊断中心,上海200025

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》2013年第9期711-716,共6页Chinese Journal of Microbiology and Immunology

基  金:国家自然科学基金(81271888)

摘  要:Ⅰ型人类免疫缺陷病毒( human immunodefi-ciency virus type 1, HIV-1)是引起全世界范围艾滋病( AIDS)流行的最主要病原体。 HIV-1属逆转录病毒科,其基因组由两条相同的正链RNA构成。要完成自身的复制(增殖),必须经历由基因组RNA逆转录形成cDNA ( complementary DNA )的过程,故每复制一代都会向基因组中引入一定频率的新的变异,从而导致了HIV-1在传播与进化过程中产生了众多亚型( subtype )及复杂的重组型( circulating re-combinant form ,CRF),而它们之间又可发生共感染( coinfection )与超感染( superinfection )。再加之抗逆转录治疗过程中产生的各种抗药性突变准种,最终为AIDS的诊断、治疗及疫苗的研发带来了极大的障碍。因此准确分析各HIV-1亚型、重组型及抗药性准种的基因组序列,对于深入了解HIV-1的传播、进化特点和AIDS的有效诊断、防控甚至攻克,具有极其重要的意义。但与此同时,也对基因测序技术的通量、速度、准确度等提出了更高的要求。

关 键 词:HIV AIDS 焦磷酸测序 HIV-1亚型 Ⅰ型人类免疫缺陷病毒 基因组RNA 逆转录病毒科 抗逆转录治疗 应用 

分 类 号:R512.91[医药卫生—内科学]

 

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