皖南黑猪CETP基因单核苷酸多态检测与遗传分析  

Single nucleotide polymorphism detection and genetic analysis of CETP gene in Wannan Black Pig

作　　者：何小雷[1] 余大华 黄龙[1] 朱朋[1] 吴涛[1] 陈亮[1] 丁月云[1] 殷宗俊[1] 

机构地区：[1]安徽农业大学动物科技学院,安徽地方畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036 [2]安徽安泰农业集团,广德242200

出　　处：《安徽农业大学学报》2013年第5期706-709,共4页Journal of Anhui Agricultural University

基　　金：国家自然科学基金(31171200);科技富民强县专项行动计划;国家农业科技成果转化资金(2011GB2C300017);省级农业科技专家大院(2012);科技部星火计划重点项目(2010GA710001)共同资助

摘　　要：以112头皖南黑猪为研究对象,采用PCR-SSCP方法检测胆固醇酯转运蛋白(cholesteryl ester transfer protein,CETP)基因的多态性。结果表明:(1)皖南黑猪CETP基因第1内含子795碱基处发生C→T突变(C795T);(2)在C795T突变位点中检测到CC、CT、TT 3种基因型,其基因型频率分别为0.625 0、0.303 6和0.071 4;C的基因频率为0.776 8,T的基因频率为0.223 2;(3)皖南黑猪CETP基因的多态信息含量(PIC)为0.286 6,该位点处于中度多态;卡方检验表明,该位点的χ2值为1.738 8,处于哈迪-温伯格平衡状态。One hundred and twelve pigs from Wannan Black population were used for detecting the poly- morphism of CETP gene by PCR-SSCP method. The results show as follows. （1） C〉T mutation （C795T） occurred in 795 base position of intron 1; （2） Three genotypes （CC, CT and TT） were found in C795T site, genotypic frequency of CC, CT and TT was 0.625 0, 0.303 6 and 0.071 4, respectively, gene frequency of C and T was 0.776 8 and 0.223 2, respectively; （3） The polymorphism information content （PIC） was 0.286 6 in Wannan Black popula- tion, which indicated it was moderate polymorphism. The X2 value was 1.738 8, which was in Hardy-Weinberg equilibrium in Wannan Black population （P〉0. 05）.

关 键 词：皖南黑猪 CETP基因 单核苷酸多态 遗传分析 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]