藏羊HIF-1α基因CDS区多态性及生物信息学分析  

作　　者：杨敏[1,2] 韩吉龙[1] 岳耀敬[1] 史兆国[2] 郭婷婷[1] 吴瑜瑜[1,2] 王朝风[1,2] 郭健[1] 刘建斌[1] 孙晓萍[1] 牛春娥[1] 杨博辉[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃兰州730050 [2]甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃兰州730070

出　　处：《江苏农业科学》2013年第10期12-16,共5页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家绒毛用羊产业技术体系建设专项资金(编号:nycytx-40-2)

摘　　要：应用DNA混池测序法检测藏羊HIF-1α基因CDS区的多态性,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行预测和分析。结果表明,在藏羊群体中发现HIF-1α基因CDS区有4个SNP,其中901G→A为错义突变,其余为同义突变;HIF-1α基因包含1个2 295 bp的开放阅读框,编码764个氨基酸,其编码蛋白属于亲水性蛋白;二级结构主要以无规则卷曲和α基因螺旋为主;HIF-1α基因编码产物氨基酸同源分析表明,藏羊HIF-1α编码的氨基酸与山羊、牦牛的遗传距离较近,具有高度同源性。

关 键 词：藏羊 HIF-1Α基因 多态性 生物信息学 

分 类 号：S826.832[农业科学—畜牧学]