基于454焦磷酸测序法的典型草原土壤真核生物多样性  被引量:10

Eukaryote diversity of typical grassland soil based on 454pyrosequencing

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作  者:井赵斌[1] 程积民[1,2] 张宝泉[3] 李红红[1] 

机构地区:[1]西北农林科技大学动物科技学院,陕西杨凌712100 [2]中国科学院水利部水土保持研究所,陕西杨凌712100 [3]西北农林科技大学资源与环境学院,陕西杨凌712100

出  处:《草业科学》2013年第11期1690-1697,共8页Pratacultural Science

基  金:中国科学院战略性先导科技专项--应对气候变化的碳收支认证及相关问题(XDA05050202);国家自然科学基金重点项目(41230852);国家林业局公益性行业科研专项(200904056);草地农业生态系统国家重点实验室

摘  要:利用454焦磷酸测序法对黄土区不同封育时期典型草地土壤真核生物多样性进行了研究。结果表明,选择的V4区引物可以扩增出土壤真核生物中的微生物、动物和植物,其中真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、绿藻门(Chlorophyta)、球囊菌门(Glomeromycota)和变形菌门(Proteobacteria)组成;动物群落区系主要包括脊椎动物门(Craniata)、节足动物门(Arthropoda)、线虫门(Nematoda)和环节动物门(Annelida);植物群落包括陆生植物(Embryophyta)和单子叶植物纲(百合纲)(Liliopsida)。在不同分类学水平,不同封育时期草地真菌群落组成具有各自的优势菌群;动物群落组成仅在种水平存在差异。草地管理实践中可以结合土壤微生物和土壤养分恢复时间的阈值对封育草地进行合理利用。454焦磷酸测序法可以用于土壤中未知动物、植物和微生物区系的研究。Eukaryote diversity of typical grassland soils with different enclosure stages was analyzed using 454 pyrosequencing. The results showed that soil eukaryotes, including microorganisms, animals and plants could be amplified and found using selected primers in V4 regions. The soil mycoflora is mainly composed of Ascomycota, Chytridiomycota, Basidiomycota, Chlorophyta, Glomermycota and Protecobac- teria; Animal community is mainly composed of Craniata, Arthropoda, Nematoda and Annelida; Plant community is mainly composed of Embryophyta and Liliopsida. Under different taxonomic levels, there are different dominant floras for mycoflora, but only differences among species for animal community, in grasslands with different enclosure stages. Rational usage of enclosure grasslands could be conducted based on combining soil microorganisms with restoration years of soil 454 pyrosequencing can be used on researches of unknown soil animals, plants and microorganisms.

关 键 词:454焦磷酸测序 18SrRNA 真核生物 微生物 封育草地 

分 类 号:S812.2[农业科学—草业科学]

 

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