汉坦病毒西安分离株基因组全序列测定及分析  

作　　者：吴瑞[1] 余鹏博[2] 李静[3] 杜全丽[1] 陈海龙[1] 刘继锋[1] 李恒新[1] 马超锋[1] 

机构地区：[1]西安市疾病预防控制中心,西安710054 [2]陕西省人民医院 [3]陕西省疾病预防控制中心

出　　处：《陕西医学杂志》2013年第12期1581-1582,1585,共3页Shaanxi Medical Journal

基　　金：陕西省科技计划项目(2011JM4010)

摘　　要：目的:测定分离自西安地区黑线姬鼠携带的的汉滩病毒毒株XAAa10091712全基因组序列,对各片段进行进化分析。方法:设计各片段引物,采用反转录-聚合酶链反应,分节段扩增各基因片段,直接用PCR产物或克隆入pMD18-T载体后进行测序分析。结果:汉坦病毒毒株XAAa10091712全基因组由11845个碱基构成,其中A为3800(31.99%),C为2085(17.55%),G为2551(21.47%),T为3444(28.99%);分S、M、L3个片段,各片段进化分析显示其与汉滩病毒贵州分离株高度同源。结论:该毒株属汉滩型病毒,与我国贵州地区汉坦病毒同源性较高,分型属于S2/M9/L4。

关 键 词：汉滩病毒 @西安分离株 基因组 序列分析 

分 类 号：R373.2[医药卫生—病原生物学]